Pavlovic não regressou aos quartel-general da Alemanha, em Herzogenaurach, na segunda-feira, após o fim de semana de folga. O médio também não pôde treinar depois, pois sofria de problemas recorrentes com as amígdalas.
"É uma grande pena para Pavlo", disse o seu companheiro de equipa no Bayern Munique, Jamal Musiala.
"Ele estava realmente ansioso por estar no Euro, esperando jogar e também tinha treinado muito bem", acrescentou.
Pavlovic também já tinha sido obrigado a falhar os jogos de março em França (2-0) e contra os Países Baixos (2:1). O médio planeia agora uma remoção das amígdalas.
Emre Can esteve pela última vez na equipa da Alemanha em setembro de 2023, sob o comando do antecessor de Nagelsmann, Hansi Flick.
Can disse recentemente que "respeita" o facto de não ter sido inicialmente convocado para o Euro-2024, mas que estava "longe de ter terminado" a sua carreira na seleção nacional.
O jogador de 30 anos criticou Nagelsmann por não o ter informado pessoalmente da sua ausência. A decisão a seu favor é também uma decisão contra o colega de clube de Pavlovic, Leon Goretzka.