O jogador de 33 anos sofreu uma suspeita de problema na virilha no nulo com o Inter de Milão na Liga dos Campeões na quarta-feira.
O City recebe o Watford, da Championship (segunda divisão), na terceira ronda da Taça da Liga, na terça-feira, e desloca-se ao terreno do Newcastle United, na Premier League, no fim de semana.
"Acho que não vai demorar muito", disse Guardiola sobre o regresso previsto de De Bruyne após o empate do City com o Arsenal (2-2): "Não posso dizer por quanto tempo, não sei para o Newcastle, mas não será por muito tempo. (Ele tem) desconforto nas pernas".
De Bruyne esteve de fora durante quatro meses com uma lesão no tendão na época passada, mas fez um regresso memorável a St James' Park com um golo na vitória por 3-2 sobre o Newcastle em janeiro.
O City lidera a classificação com 13 pontos após cinco jogos.